该项目查明了我国HIV亚型的地区和人群分布；与十年前相比，B/C重组株取代B亚型毒株成为我国最主要的HIV流行株。我国CRF07-BC HIV-1毒株具有独特重组模式,具有自身特殊的基因变异特征和生物学特性；计算了我国主要HIV毒株的基因变异速率，并进而测算出我国近两年大幅增长的新报告HIV/AIDS病例大多为9～10年前发生的感染。该研究加深了对HIV进化的认识，阐明了CRF-07BC毒株体内外复制能力较低的分子基础, 并为国家正确评估防治工作效果提供了重要的科学依据。一方面，本研究所取得的成果极大地丰富了人们对中国艾滋病流行情况的了解，并进而提出符合我国国情的艾滋病防治策略；另一方面也为我国其它传染病的研究和预防控制提供了一个有益的探索和尝试。

        该项目建立了包括HIV基因序列、流行病学、生物学、遗传和免疫学数据的中国HIV/AIDS研究数据库（网址：http://www.ciprancaids.org.cn/db2006.php）并开发了初步的应用界面程序，建立了与之配套的毒种样本库。与仅含有序列资料的国际基因库相比，我国的复合型数据库具有更高的学术研究价值。该数据库既可支持国内外单位的科学研究,也将进一步促进我国HIV试剂的改进、耐药毒株的监测和主要流行株疫苗的研发。

        该项目先后共有33个单位159人参与，本成果的获得是多单位团结协作的典范。（性艾中心病毒与免疫研究室）